近年来，睢县医疗卫生事业取得了长足的进步与发展，农村卫生、中医工作、妇幼保健、计划免疫、传染病防治、卫生监督等各项工作跃居全市乃至全省先进行列。全县共有10个县直医疗卫生单位：人民医院、中医院、公疗医院、妇幼保健院、疾控中心、卫生监督所、卫校、卫校附属医院、120指挥中心、新农合管理办公室，24所乡镇卫生院，共有在职干部职工2328人，其中卫生专业技术人员1712人。2009年登记注册村级卫生室695个。
搞好优质服务和行风建设，努力解决群众看病难、看病贵问题。几年来，睢县卫生局将优质服务作为全县卫生工作的重点，将优质服务工作贯穿于医疗卫生的各个层面。拓宽了各级医疗卫生单位服务领域和服务范围，全面提升了医疗服务能力。一些全新的服务理念和便民服务措施得到了应用和推广。“社会效益至上、病人满意第一”的工作观念已深入人心。全县卫生系统先后开展了“正行风、树形象”以及“治理医药购销领域商业贿赂”集中行动。各级医疗机构全面实施了医疗服务价格公示、“住院病人一日清单”和“双十公示”制度，坚决杜绝大处方、滥检查以及开单提成等不良行为；县乡医疗机构临床用药全部纳入集中招标采购范围；在此基础上，睢县在全市率先推行了县直医疗卫生单位医技检查结果互通、互认制度，真正做到让利患者，取信于民。进入2010年以来，睢县卫生系统以纠风工作为载体，进一步加强医疗卫生单位医德医风建设和行业作风建设，在全县范围内开展了“十佳医生”、“十佳护士”选优评先活动。同时，加大医药购销和医疗卫生服务中不正之风的查处力度，坚决禁止大处方、滥检查，彻底纠正科室和医务人员经济收入直接挂钩的分配办法，避免过度医疗，减轻群众就医负担。不断加大了医疗质量管理力度，组织专业人员对全县医疗卫生单位的医疗质量管理、各项规章制度落实情况进行定期不定期督查，发现问题及时解决。为提高医务人员业务素质，卫生局将强化医务人员业务技术教育培训，纳入各单位年度目标管理，采取走出去、请进来的方法，有组织、有计划地开展专家讲座、集中培训、业务考核、岗位练兵等活动，提高了医务人员的业务和理论素质，有效地防范了医疗事故和医疗纠纷的发生。
搞好防疫保健，保障全县人民健康权益。几年来，睢县从加强基层防保队伍建设入手，狠抓各项卫生法律、法规的贯彻落实，圆满完成了各项防疫保健工作任务。全省防疫站建设工作及全市基层卫生及妇幼工作现场会分别在睢县召开。2010年以来，睢县进一步加强了对传染病疫情监督、监测力度。共进行4次冷链运转，并积极在乡镇推行门诊化接种工作，免疫规划疫苗全程接种率及覆盖率均达97％以上。在搞好疾病控制常规工作的基础上，在全县范围内开展乙脑和甲流感疫苗的接种工作。着力完善全县妇幼保健体系建设，在全县范围内开展了免费妇女病普查普治工作，满足了妇女儿童卫生保健服务需要。
搞好重大传染病防治，公共卫生体系建设初具规模。不断完善重大传染病防治工作长效机制，在全市率先建立健全了《卫生系统突发公共事件应急预案》、《睢县卫生系统重大灾害事件应急预案》，以及非典、艾滋病、禽流感、手足口病、甲型H1N1流感防控等一系列规章制度和工作方案。进一步完善了预防和救治队伍建设，整合全县卫生资源，组成了各级防治梯队，做到方案、组织、物资、人员四落实，使睢县的重大传染病防治工作做到了科学管理、常备不懈、反应迅速、措施得力。全县的重大传染病防治工作逐步纳入了制度化正规化渠道，在非典、禽流感以及艾滋病、手足口病、甲流感防治等工作中取得了显著成绩，保障了全县人民的身体健康和社会经济的正常发展。切实做好艾滋病防治工作。认真开展了全球基金艾滋病防治项目、《艾滋病防治条例》宣传培训，以及母婴阻断等各项防治工作，有力地促进了艾滋病防治工作的健康开展。建设和完善了突发公共卫生事件应急处理的硬件设施。投资40万元建立了防疫站和县医院两个初筛实验室。先后建立了1个县级、10个乡级、7个村级艾滋病定点救治机构。投资500余万元建成了县疾控中心和县医院传染病区，传染病防控体系初具规模。
切实加强农村卫生工作，提升农村医疗卫生水平。把搞好农村卫生工作列为各项工作的重中之重，政策上给予倾斜，人员力量上给予照顾，确保了全县农村卫生工作与社会事业的健康协调发展。针对全县农村卫生的实际情况，制定和完善了睢县农村卫生事业发展总体规划。以人才培养为突破口，实施人才强医战略。加快科教兴医步伐，全面实施人才强医战略，着力做好农村卫生人才培养工作。2007年以来，乡镇卫生院到市级以上医疗卫生单位进修学习76人，县直四家医院无偿培训乡镇专业技术人员133人次。几年来，共举办各类村级卫生技术人员专业知识培训36次，1万余人次。全县初级以上职称卫生技术人员由2003年底的434人增加到2009年的921人，在职无学历人员由2003年底的46.7%下降到目前的5.1%，为全县农村卫生工作健康发展提供了坚强的人才保证。千方百计引进项目资金，积极改善农村办医条件。2007年以来，通过向上争取各种建设项目达40余个，先后投资9000余万元建成了县医院传染病区及新病房楼、中医院病房楼、县疾控中心综合楼、县妇幼保健院综合楼，添置了核磁共振、螺旋CT、CR、ICU设备、救护车等大型医疗设备340余台件；同时，抢抓国家扩大内需和医改机遇，成功争取到投资3700万元的县医院医疗急救大楼建设项目。2008年圆满完成了全县所有24所乡镇卫生院改扩建工作任务，利用项目资金完成了 229所规范化村卫生室建设。2009年，争取国债项目顺利开展了5个中心乡卫生院建设工作，目前已全部完工并投入使用；2010年，着手改建4所、装备5所乡镇卫生院，积极争取项目资金，为乡镇卫生院配备基础医疗设备。通过几年来的努力，睢县农村卫生基础设施建设取得了突飞猛进的发展，全县所有乡镇卫生院全部达到了“一无三配套”标准，乡镇卫生院固定资产较2003年增加了1570万元；标准化村级卫生室达标率48.2%，极大提高农村卫生服务整体水平。
以新农合等惠农政策为契机，切实减轻农民群众就医负担。不断加强新农合制度建设，提高新农合管理水平。加强基金管理，强化监督机制，做到新农合基金专户存储，专帐管理，专款专用，封闭运行。强化对定点医疗机构管理，严格禁止增加参合患者负担的行为。充分发挥舆论监督作用，广泛接受人大、政协以及社会各界监督，及时发现和解决在新农合工作中存在的问题。根据本县新农合运行情况，适时调整新农合实施方案，提高补偿标准，使参合农民的受益比例由原来的30%提高了到了45%。截止目前，全县累计补偿参合农民1072665人次，补偿金额约1.7亿元。其中2009年补偿350227人次，补偿金额5999余万元，2010年1-8月份补偿参合患者226731人次，3962.7万元。有效地保障了全县参合农民的利益。同时，睢县积极实施了“降消”项目和全球基金艾滋病、结核病治疗项目，其中“降消”项目从2005年6月启动以来，共救助农村贫困孕产妇42000余人，救助金额628余万元。新型农村合作医疗等惠农政策的实施，切实减轻了农民医疗费用负担，体现了党和政府对农民的关怀。
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